MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 2183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011991	GAG	2	6	29754	29759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109142
502	NC_011991	CGA	2	6	29875	29880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
503	NC_011991	GC	3	6	29882	29887	0 %	0 %	50 %	50 %	222109143
504	NC_011991	TCA	2	6	30049	30054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109143
505	NC_011991	GC	3	6	30093	30098	0 %	0 %	50 %	50 %	222109143
506	NC_011991	GTTG	2	8	30109	30116	0 %	50 %	50 %	0 %	222109143
507	NC_011991	ACG	2	6	30138	30143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
508	NC_011991	CGG	2	6	30226	30231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
509	NC_011991	TGCC	2	8	30243	30250	0 %	25 %	25 %	50 %	222109143
510	NC_011991	ACCC	2	8	30398	30405	25 %	0 %	0 %	75 %	222109143
511	NC_011991	GAC	2	6	30455	30460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
512	NC_011991	GA	3	6	30487	30492	50 %	0 %	50 %	0 %	222109143
513	NC_011991	CGG	2	6	30496	30501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
514	NC_011991	CGC	2	6	30538	30543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109143
515	NC_011991	ACC	2	6	30561	30566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109143
516	NC_011991	AGC	2	6	30600	30605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
517	NC_011991	T	6	6	30637	30642	0 %	100 %	0 %	0 %	222109143
518	NC_011991	CT	3	6	30643	30648	0 %	50 %	0 %	50 %	222109143
519	NC_011991	TTC	2	6	30680	30685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109143
520	NC_011991	CAA	2	6	30716	30721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109143
521	NC_011991	ATC	2	6	30728	30733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109143
522	NC_011991	AGGT	2	8	30767	30774	25 %	25 %	50 %	0 %	222109143
523	NC_011991	TCGCG	2	10	30799	30808	0 %	20 %	40 %	40 %	222109143
524	NC_011991	CAG	2	6	30809	30814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
525	NC_011991	CGT	2	6	30832	30837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
526	NC_011991	T	7	7	30841	30847	0 %	100 %	0 %	0 %	222109143
527	NC_011991	GAT	2	6	30856	30861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109143
528	NC_011991	CAG	2	6	30893	30898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
529	NC_011991	CAG	2	6	30911	30916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
530	NC_011991	GCC	2	6	30951	30956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109143
531	NC_011991	CGA	2	6	30961	30966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
532	NC_011991	ATC	2	6	30996	31001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109143
533	NC_011991	GAG	2	6	31017	31022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109143
534	NC_011991	GTC	2	6	31023	31028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
535	NC_011991	GCC	2	6	31092	31097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109143
536	NC_011991	TCG	2	6	31230	31235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
537	NC_011991	CGTT	2	8	31241	31248	0 %	50 %	25 %	25 %	222109143
538	NC_011991	CTC	3	9	31295	31303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109143
539	NC_011991	GT	3	6	31315	31320	0 %	50 %	50 %	0 %	222109143
540	NC_011991	AGGT	2	8	31395	31402	25 %	25 %	50 %	0 %	222109143
541	NC_011991	GGC	2	6	31416	31421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
542	NC_011991	GGC	2	6	31466	31471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
543	NC_011991	TGCC	2	8	31489	31496	0 %	25 %	25 %	50 %	222109143
544	NC_011991	CAT	2	6	31531	31536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109143
545	NC_011991	GCTC	2	8	31626	31633	0 %	25 %	25 %	50 %	222109143
546	NC_011991	CGG	2	6	31647	31652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
547	NC_011991	AGT	2	6	31666	31671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109143
548	NC_011991	CTT	2	6	31709	31714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109143
549	NC_011991	CGA	2	6	31720	31725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
550	NC_011991	GC	3	6	31806	31811	0 %	0 %	50 %	50 %	222109143
551	NC_011991	CGT	2	6	31813	31818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
552	NC_011991	CGG	3	9	31846	31854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
553	NC_011991	TCG	2	6	31881	31886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
554	NC_011991	ACC	2	6	31908	31913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109143
555	NC_011991	ACC	2	6	31917	31922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109143
556	NC_011991	TGG	2	6	32035	32040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109143
557	NC_011991	CGC	2	6	32193	32198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109143
558	NC_011991	TGC	2	6	32215	32220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
559	NC_011991	TCA	2	6	32232	32237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109143
560	NC_011991	GCC	2	6	32388	32393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109143
561	NC_011991	TTC	2	6	32468	32473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109143
562	NC_011991	CGT	2	6	32509	32514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
563	NC_011991	GCG	2	6	32527	32532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
564	NC_011991	T	6	6	32535	32540	0 %	100 %	0 %	0 %	222109143
565	NC_011991	CAGAT	2	10	32606	32615	40 %	20 %	20 %	20 %	222109143
566	NC_011991	A	6	6	32767	32772	100 %	0 %	0 %	0 %	222109143
567	NC_011991	AGA	2	6	32857	32862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109143
568	NC_011991	GGC	2	6	32896	32901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
569	NC_011991	TCG	3	9	32964	32972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
570	NC_011991	CTT	2	6	33004	33009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109143
571	NC_011991	GCCT	2	8	33012	33019	0 %	25 %	25 %	50 %	222109143
572	NC_011991	TCC	2	6	33170	33175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109143
573	NC_011991	ACG	2	6	33190	33195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
574	NC_011991	AGT	2	6	33818	33823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109144
575	NC_011991	TAGT	3	12	33820	33831	25 %	50 %	25 %	0 %	222109144
576	NC_011991	AAG	2	6	33873	33878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109144
577	NC_011991	CTTC	2	8	33899	33906	0 %	50 %	0 %	50 %	222109144
578	NC_011991	TAA	2	6	34058	34063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222109144
579	NC_011991	CGG	2	6	34070	34075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109144
580	NC_011991	CAC	2	6	34197	34202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109144
581	NC_011991	TCA	2	6	34213	34218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109144
582	NC_011991	TAA	2	6	34262	34267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222109144
583	NC_011991	GCC	2	6	34270	34275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109144
584	NC_011991	CGG	2	6	34283	34288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109144
585	NC_011991	TTGA	2	8	34335	34342	25 %	50 %	25 %	0 %	222109144
586	NC_011991	GTC	2	6	34393	34398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109144
587	NC_011991	TGA	2	6	34485	34490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109144
588	NC_011991	TCA	2	6	34537	34542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109144
589	NC_011991	AGGG	2	8	34725	34732	25 %	0 %	75 %	0 %	222109144
590	NC_011991	GCC	2	6	35040	35045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109144
591	NC_011991	TGCT	2	8	35109	35116	0 %	50 %	25 %	25 %	222109144
592	NC_011991	GCG	2	6	35120	35125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109144
593	NC_011991	CGG	3	9	35131	35139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109144
594	NC_011991	TGA	2	6	35201	35206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109144
595	NC_011991	C	7	7	35433	35439	0 %	0 %	0 %	100 %	222109144
596	NC_011991	ATG	2	6	35495	35500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109144
597	NC_011991	CGA	2	6	35506	35511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109144
598	NC_011991	CGA	2	6	35520	35525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109144
599	NC_011991	TGA	2	6	35549	35554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109144
600	NC_011991	GAAA	2	8	35560	35567	75 %	0 %	25 %	0 %	222109144
601	NC_011991	ACT	2	6	35783	35788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109145
602	NC_011991	CGC	2	6	35937	35942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109145
603	NC_011991	CG	3	6	36112	36117	0 %	0 %	50 %	50 %	222109145
604	NC_011991	CGAC	2	8	36169	36176	25 %	0 %	25 %	50 %	222109145
605	NC_011991	GA	3	6	36429	36434	50 %	0 %	50 %	0 %	222109146
606	NC_011991	TTC	2	6	36472	36477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109146
607	NC_011991	CAG	2	6	36489	36494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109146
608	NC_011991	GCC	2	6	36622	36627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109147
609	NC_011991	AAG	2	6	36674	36679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109147
610	NC_011991	A	6	6	36701	36706	100 %	0 %	0 %	0 %	222109147
611	NC_011991	CCTG	2	8	36737	36744	0 %	25 %	25 %	50 %	222109147
612	NC_011991	GGC	2	6	36794	36799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109147
613	NC_011991	CTC	2	6	36840	36845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109147
614	NC_011991	T	6	6	36850	36855	0 %	100 %	0 %	0 %	222109147
615	NC_011991	AG	4	8	36964	36971	50 %	0 %	50 %	0 %	222109148
616	NC_011991	GAA	2	6	36978	36983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109148
617	NC_011991	TGCGG	2	10	37002	37011	0 %	20 %	60 %	20 %	222109148
618	NC_011991	CGG	2	6	37056	37061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109148
619	NC_011991	CAT	3	9	37088	37096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109148
620	NC_011991	GGTC	2	8	37208	37215	0 %	25 %	50 %	25 %	222109148
621	NC_011991	TCG	2	6	37276	37281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109148
622	NC_011991	GCG	2	6	37307	37312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109148
623	NC_011991	GTC	2	6	37349	37354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109148
624	NC_011991	TC	3	6	37372	37377	0 %	50 %	0 %	50 %	222109148
625	NC_011991	GCT	2	6	37437	37442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109148
626	NC_011991	GGA	2	6	37475	37480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109148
627	NC_011991	TGC	2	6	37598	37603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109148
628	NC_011991	CGG	2	6	37643	37648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109148
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756	NC_011991	GC	3	6	44420	44425	0 %	0 %	50 %	50 %	222109152
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